Chùa Mani Cholakhan nằm trên một hòn đảo được bao quanh bởi "sông Lopburi", một nhánh chính chảy từ sông Chao Phraya. Trong quá khứ, con đường thủy này từng là tuyến đường vận chuyển chính kết nối Cung điện Vua Narai với nhiều cộng đồng và thành phố khác nhau. Không khí ven sông quanh chùa rất đẹp và thanh bình, đặc biệt là gần "Chùa Luang Phor Saeng" đứng bên bờ sông. Lối sống ven sông của người dân địa phương Lopburi vẫn còn thể hiện rõ qua các chuyến du ngoạn bằng thuyền và các lễ hội truyền thống trên nước được tổ chức hàng năm. Do đó, "sông Lopburi" không chỉ là một nguồn tài nguyên thiên nhiên; nó là một phần quan trọng của lịch sử đã duy trì ngôi chùa và thành phố trong nhiều thế kỷ.