Jodo-in là một tiểu đền được thành lập năm 1496 để phục hồi Byodo-in. Thuộc về phái Jodo, nơi đây có tượng Phật A Di Đà ngồi và các di vật văn hóa quý hiếm. Cùng với Saisho-in, nơi đây chia sẻ trách nhiệm duy trì di sản Thế giới UNESCO linh thiêng này.