Hệ sinh thái dưới nước ở dãy núi Phu Phan thường là nơi sinh sống của các loài động vật thủy sinh nhỏ bé thích nghi tốt với môi trường nước trong, chẳng hạn như nhiều loại cá tuế, cũng như các loài lưỡng cư như ếch và cóc sống trong các kẽ đá.